Projecten per jaar
Organisatieprofiel
Over ons
Applied Physics (APHY): is een jonge en multidisciplinaire groep onderzoekers behorende tot de vakgroepen Toegepaste Natuurkunde en Fotonica (TONA) en Fysica (DNTK). Wij combineren experimenteel en theoretische onderzoek naar niet-lineaire, complexe en dynamische systemen gebruik makend van geavanceerde methodes uit de fysica. Naast fotonische systemen (zoals bv. halfgeleiderlasers en hun dynamica, fotonische metamaterialen, dissipatieve solitonen en andere spatio-temporele structuren, enz.) worden meer en meer ook andere dynamische systemen, zoals o.a. biologische systemen, neurale netwerken, enz. bestudeerd. Zie website APHY: http://we.vub.ac.be/aphy/ De huidige onderzoekslijnen illustreren het multidisciplinaire karakter van het onderzoek: - Dynamica van halfgeleiderlasers: niet-lineaire dynamica, bifurcatietheorie en theorie van stochastische processen worden toegepast op lasers, i.h.b. halfgeleiderlasers. Deze theoretische studie laat ons toe om het dynamische gedrag (bv. bi- en multistabiliteit, exciteerbaarheid) van half- geleiderlasers te bestuderen. Deze theoretische voorspellingen worden in onze labs getoetst aan experimenten. - Coherentie eigenschappen van lasers: experimentele en theoretische studie van de coherentie eigenschappen van halfgeleiderlasers en onderzoek naar methodes om de ruimtelijke coherentie op gecontroleerde wijze te veranderen. Op deze wijze kunnen we ruimtelijk incoherente emissie genereren met een laserbron. In ons onderzoek trachten we dit unieke werkingsgebied experimenteel te karakteriseren, te begrijpen, modellen te ontwerpen, te optimaliseren en toe te passen in innovatieve applicaties. - Metamaterialen: metamaterialen zijn complexe structuren die worden opgebouwd uit kleine, resonante, elektrische circuits. Deze bouwstenen zijn veel kleiner dan de golflengte van het licht, waardoor ze de elektromagnetische eigenschappen van de materialen volledig bepalen en zo de rol vervullen van de atomen uit traditionele natuurlijke materialen. Zo simuleren we bv. de elementaire metamateriaal-bouwstenen over fotonische devices gebaseerd op metamaterialen tot de ontwikkeling van metamateriaal-gebaseerde systemen met behulp van de technieken uit de transformatieoptica. - Dissipatieve solitonen: we bestuderen theoretisch de structuren die ontstaan in uitgebreide spatiale systemen in de natuur, zowel uitgestrekte patronen als gelokaliseerde structuren (spatiale of dissipatieve solitonen). We onderzoeken het dynamisch gedrag van deze solitonen (in tijd en ruimte) en trachten de onderliggende bifurcatiestructuur te ontrafelen. - Gekoppelde netwerken met tijdsvertraging (delay): we bestuderen theoretisch (kleine) netwerken van systemen (oscillatoren, lasers, enz.) die gekoppeld worden met een tijdsvertraging. Bij zulke systemen kan synchronisatie optreden, waarbij de oscillatoren trillen met dezelfde frequentie en/of fase. I.h.b. kijken we naar het bestaan en de stabiliteit van zulke gesynchroniseerde oplossingen, en de invloed van de netwerk topologie en van de delay. - Neurale netwerken gebaseerd op delay: we hebben recent aangetoond dat zulke systemen universele informatieverwerkende eigenschappen hebben (Reservoir Computing of Liquid State Machines). Met 1 enkele niet-lineaire node kunnen we dezelfde informatieverwerkende prestaties halen als met een neuraal netwerk bestaande uit 400 nodes. We onderzoeken die informatieverwerkende capaciteit verder en trachten deze te verklaren en te implementeren m.b.v. (opto)-elektronische systemen. - Dynamische modellering van biologische systemen: we bestuderen de dynamica van gen transcriptie, i.h.b. de dynamica van Toxine-Antitoxine systemen in bacteria and archaea. In samenwerking met Structural Biology Brussels bestuderen we modellen voor de gen regulatie en de functie ervan in de cel met verschillende technieken: differentiaalvergelijkingen, stochastische methoden, enz. Daarnaast zijn we recent ook begonnen met de dynamische modellering van biologische ecosystemen, zoals de darmflora, in samenwerking met de groep van J. Raes.
Vingerafdruk
Samenwerkingen en hoofdonderzoeksgebieden uit de afgelopen vijf jaar
Profielen
-
-
Martain Dagnelie
- Vrije Universiteit Brussel
- Natuurkunde - External employee
- Faculteit van de Wetenschappen
- Toegepaste Natuurkunde
Persoon: Onderzoeker, Doctoraat
-
Jan Danckaert
- Vrije Universiteit Brussel
- Toegepaste Natuurkunde en Fotonica - Gewoon hoogleraar
- Natuurkunde - Gewoon hoogleraar
- Data Analytics Lab - Gewoon hoogleraar
- Toegepaste Natuurkunde
Persoon: Onderzoeker, Professor
-
Sophie de Buyl
- Vrije Universiteit Brussel
- Biologie - Hoofddocent
- Toegepaste Biologische Wetenschappen - Hoofddocent
- Natuurkunde - Hoofddocent
- Data Analytics Lab - Hoofddocent
- Toegepaste Natuurkunde
Persoon: Onderzoeker, Professor
-
-
FWOTM1305: Modelgedreven ontwerp en in vivo implementatie van een multi-level dynamische pathway- regulatie die transcriptionele en post-transcriptionele regulatie combineert
Dagnelie, M. (Mandataris), de Buyl, S. (Administrative Promotor) & Peeters, E. (CoI (Co-Promotor))
1/11/25 → 31/10/29
Project: Fundamenteel
-
FWOAL1146: Geintegreerde fotonische Ising machines
Van Der Sande, G. (Administrative Promotor)
1/01/25 → 31/12/28
Project: Fundamenteel
-
OZR4283: Bilateral cooperation within the framework of a joint doctoral project: benchfee for joint PhD VUB - UCLouvain, JOSEPH Sebastian
de Buyl, S. (Administrative Promotor)
1/04/24 → 31/03/28
Project: Fundamenteel
-
EUPOM152: Erasmus+ Key Action2: Hervorming van het bestuur van PhD-programma's aan Palestijnse instellingen voor hoger onderwijs
Zhu, C. (Administrative Promotor), Danckaert, J. (Medewerker), François, K. (Medewerker) & Zomlot, Z. (Medewerker)
1/04/24 → 31/03/27
Project: Fundamenteel
-
OZR4333: Bilateral cooperation within the framework of a joint doctoral project: benchfee for joint PhD VUB - UGent, DE PRINS Robbe
Van Der Sande, G. (Administrative Promotor)
16/01/24 → 15/01/28
Project: Fundamenteel
Onderzoeksoutput
-
A benchmark of expert-level academic questions to assess AI capabilities
Center for AI Safety, Scale AI & HLE Contributors Consortium, 29 jan. 2026, In: Nature. 649, 8099, blz. 1139-1146 15 blz.Onderzoeksoutput: Article › peer review
Open Access18 Citaten (Scopus) -
AI voelt zich onvoldoende uitgedaagd door de Belgen, en dat is een probleem
Ginis, V., 26 feb. 2026, De Standaard 1 blz.Onderzoeksoutput: Article › Vulgarizing
-
Dataset artefacts can partially drive the measured decline in disruption
Holst, V., Algaba, A., Tori, F., Wenmackers, S. & Ginis, V., 13 aug. 2026, In: Nature. 656, 8127, blz. E7-E13 26 blz.Onderzoeksoutput: Article › peer review
1 Citaat (Scopus) -
Development and characterization of pNarsenic: a naringenin-inducible biosensor for arsenic in Escherichia coli
Crabbe, V., Unal, E., De Graeve, S., Guerra, D. G., Peeters, T., de Buyl, S., Peeters, E. & Bervoets, I., 10 jan. 2026, In: Synthetic Biology. 11, 1, 6 blz., ysag001.Onderzoeksoutput: Article › peer review
Open Access -
Early Evidence of Vibe-Proving with Consumer LLMs: A Case Study on Spectral Region Characterization with ChatGPT-5.2 (Thinking)
Verbeken, B., Vagenende, B., Guerry, M.-A., Algaba, A. & Ginis, V., 21 feb. 2026, ArXiv, 41 blz.Onderzoeksoutput: Preprint
Bestand17 Downloads (Pure)
Activiteiten
-
European Embedded Control Institute International Graduate School on Control 2026 - Biological Control Systems
Dagnelie, M. (Participant)
15 jun. 2026 → 19 jun. 2026Activiteit: Participation in workshop, seminar
-
Step inside the world of real diplomacy
Lapeyre de Cabanes, X. (Keynote speaker), Danckaert, J. (Speaker) & Vandenbussche, W. (Presenter)
24 apr. 2026Activiteit: Talk at a public lecture/debate
-
Jury member Master Thesis "Neural operators for chaotic systems "
de Buyl, S. (Reviewer)
2025Activiteit: Other
-
Optimizing information in neural induction constraints the geometry of ascidian embryos
de Buyl, S. (Speaker)
26 mei 2025Activiteit: Talk or presentation at a workshop/seminar
-
Faculteit van de Wetenschappen (Organisatie)
de Buyl, S. (Jury)
2 apr. 2025Activiteit: Member of PhD committee
Datasets
-
[Code] Simulations: Is Intergenerational Elasticity (IGE) a Misleading Measure of Wealth Mobility?
Kim, S. (Creator), Vanhoyweghen, A. (Project Member), Ryckbosch, W. (Project Member) & Ginis, V. (Project Member), Zenodo, 4 feb. 2025
Dataset
-
Raw data for Large Language Models Reflect Human Citation Patterns with a Heightened Citation Bias
Algaba, A. (Creator), Mazijn, C. (Creator), Holst, V. T. (Creator), Tori, F. J. (Creator), Wenmackers, S. (Creator) & Ginis, V. (Creator), Zenodo, 25 mei 2024
Dataset
-
Replication Data for "Dataset Artefacts are the Hidden Drivers of the Declining Disruptiveness in Science"
Holst, V. T. (Creator), Algaba, A. (Creator), Tori, F. J. (Creator), Wenmackers, S. (Creator) & Ginis, V. (Creator), Zenodo, 16 feb. 2024
Dataset
-
Supplementary data to 'Development and characterization of pNarsenic: a naringenin-inducible biosensor for arsenic in Escherichia coli'
Crabbe, V. (Data Curator), Unal, E. (Data Collector), de Buyl, S. (Supervisor), Peeters, E. (Supervisor), Bervoets, I. (Supervisor), Peeters, T. (Project Member), Guerra, D. G. (Project Member) & De Graeve, S. (Researcher), Zenodo, 19 dec. 2025
DOI: 10.5281/zenodo.17154084, https://zenodo.org/records/17154084
Dataset
-
Replication Data for "Benchmarks Saturate When The Model Gets Smarter Than The Judge"
Ballon, M. K. L. (Creator), Algaba, A. (Other), Verbeken, B. (Other) & Ginis, V. (Supervisor), Zenodo, 26 jan. 2026
Dataset