Structural Biology Brussels

Ekaterina Baranova
- Vrije Universiteit Brussel
- Toegepaste Biologische Wetenschappen - Unpaid employee
- Structural Biology Brussels - Unpaid employee
Persoon: Onderzoeker
20172025
Eva Beke
- Vrije Universiteit Brussel
- Toegepaste Biologische Wetenschappen - External employee, Niet gedefinieerd, Technisch medewerker
- Structural Biology Brussels - External employee
Persoon: Onderzoeker, Administratief/technisch personeel
Safa Ben Taarit
- Vrije Universiteit Brussel
- Toegepaste Biologische Wetenschappen - External employee
- Structural Biology Brussels - External employee
Persoon: Onderzoeker, Administratief/technisch personeel
20252025
Marjolijn Berghmans
- Vrije Universiteit Brussel
- Toegepaste Biologische Wetenschappen - External employee, doctoral student
- Structural Biology Brussels - External employee, doctoral student
- Faculteit van de Wetenschappen
Persoon: Onderzoeker, Doctoraat
20202025
Thijs Bodson
- Vrije Universiteit Brussel
- Toegepaste Biologische Wetenschappen - External employee, pre-doctoral researcher
- Structural Biology Brussels - External employee, pre-doctoral researcher
- Faculteit van de Wetenschappen
Persoon: Onderzoeker, Doctoraat
20242024

1 Niet gestart
32 Actief
72 Afgelopen

FWOTM1348: Een nieuw porine eiwit regelt de vorming van polysaccharide capsules, een belangrijke virulentiefactor in de prioritaire humane pathogeen Acinetobacter baumannii
Ben Taarit, S. & Van der Henst, C.
1/11/25 → 31/10/29
Project: Fundamenteel
FWOSB216: De novo ontwerp van een steroïdenbiosensor en karakterisering van zijn vermogen tot steroïdenfingerprinting
Guiziou, T. & Vorobieva, A. A.
1/11/25 → 31/10/29
Project: Fundamenteel
FWOTM1328: Zacht als zijde, sterk als staal: rationeel biotechniek van eiwit nanovezels voor de ontwikkeling van een nieuwe generatie textiel materialen
Jacobs, W. & Remaut, H. K.
1/11/25 → 31/10/29
Project: Fundamenteel
FWOSB198: Uibreiden van de Nanobody Toolbox: Computationele en Experimentele methodes voor het fuseren van Nanobodies met andere eiwitten
Kocev, A., Vranken, W. & Steyaert, J.
1/11/25 → 31/10/29
Project: Fundamenteel
IOFPOC67: IOF PoC “Positieve Allosterische Modulatoren van Receptor Tyrosine Kinases met ligand-specificiteit en spatio-temporele precisie als een nieuwe therapeutische strategie.”
Steyaert, J.
1/07/25 → 31/01/27
Project: Toegepast

3D Nanoendoscopy-AFM: Redefining mechanosensitivity in bone cells.
Yvanoff, C., Shahidul Alam, M., Mubarak Hosain, M., Kasas, S., Fukuma, T. & Willaert, R., 1 feb. 2025.
Onderzoeksoutput: Poster
A biosensor-based phage display selection method for automated, high-throughput Nanobody discovery
De Keyser, P., Kalichuk, V., Zögg, T., Wohlkönig, A., Schenck, S., Brunner, J., Pardon, E. & Steyaert, J., 1 mrt. 2025, In: Biosensors and Bioelectronics. 271, 14 blz., 116951.
Onderzoeksoutput: Article › peer review

6 Citaten (Scopus)
A color-tailored fluorogenic sensor for hydrogen peroxide
Potekhina, E. S., Bass, D. I., Ezeriņa, D., Fleckenstein, D. D., Chebotarev, A. S., Sysoeva, V. A., Maltsev, D. I., Pak, V. V., Moshchenko, A. A., Sokolov, A. I., Myasnyanko, I. N., Baranov, M. S., Fedotov, A. B., Zheltikov, A. M., Lanin, A. A., Messens, J. & Belousov, V. V., 16 okt. 2025, In: Nature Chemical Biology. blz. 1-32 32 blz.
Onderzoeksoutput: Article › peer review

Bestand

1 Citaat (Scopus)
A comparative study between phenylglycine and phenylalanine derived peptide hydrogels: towards atomic elucidation
Bertouille, J., Van Lommel, R., Aerts, R., Dockx, L., Mangialetto, J., Van den Brande, N., Willaert, R., De Proft, F., Hennecke, U., Martin, C., A. Herrebout, W., Jansen, T. L. C., Cunha, A. V. & Ballet, S., 7 feb. 2025, In: Materials Today Chemistry. 28 blz., 102593.
Onderzoeksoutput: Article › peer review

3 Citaten (Scopus)
AFM and optical microscopy based nanomotion detection techniques and applications
Villalba, M. I., Yvanoff, C., Radonicic, V., Moreno Córdoba, M., Willaert, R. & Kasas, S., 2025.
Onderzoeksoutput: Poster

UNIVERSITE CATHOLIQUE DE LOUVAIN (Externe Organisatie)
Joris Messens (Member)
2 jul. 2025
Activiteit: Member of PhD committee
Research stay at the Centre de neurosciences psychiatriques (CNP)
Charlotte Yvanoff (Participant)
24 feb. 2025 → 28 feb. 2025
Activiteit: Research and Teaching at External Organisation
Co-organizer 5th international TRP meeting in Leuven
Janine Brunner (Chair)
17 sep. 2025 → 19 sep. 2025
Activiteit: Participation in conference
Member of PhD committee of Silke Vercauteren “The genetic landscape underlying persistence in Escherichia coli” (Evenement)
Wim Versées (Jury)
22 jan. 2025
Activiteit: Member of PhD committee
ChemPhysBio2025 - Imaging Biology: Interdisciplinary Tools and Techniques to Unravel Cellular Dynamics
Siska Somers (Participant)
16 jun. 2025 → 20 jun. 2025
Activiteit: Participation in workshop, seminar

3D SUper-Resolutie tot cryo-ElectronenMIcroscopie voor de studie van nanoschaal subcellulaire dynamiek en structuur die verandert in Neurodegeneratieve ziekten - 3SURE MIND
Han Karel Remaut (Consortium partner)
Toegepaste Biologische Wetenschappen
Uitrusting/faciliteit: no e-resource/single sited
Atomic force microscopy” (AFM)-nanobiotechnologie gebaseerd platform voor het bereiken van de dynamiek van afzonderlijke moleculen tot veelzijdige materialen en celmechanica
Ronnie Willaert (Infrastructure coordinator)
Toegepaste Biologische Wetenschappen
Uitrusting/faciliteit: no e-resource/single sited
ELIXIR Infrastructuur voor Data en Services om Life-Sciences Onderzoek in Vlaanderen te versterken
Wim Vranken (Consortium partner) & Tom Lenaerts (Consortium partner)
Federated labs AI and Robotics
Uitrusting/faciliteit: e-resource/distributed
INSTRUCT Flanders - Nanobodies4INSTRUCT
Jan Steyaert (Scientific coordinator)
Toegepaste Biologische Wetenschappen
Uitrusting/faciliteit: no e-resource/single sited
Voordelige 100 kV-cryogene elektronenmicroscoop met hoge resolutie voor de bepaling van bijna atomaire eiwitstructuur
Ruslan Efremov (Infrastructure coordinator)
Structural Biology Brussels
Uitrusting/faciliteit: no e-resource/single sited

The Lrs14-like AbfR1 homolog from Metallosphaera sedula is a nucleoid-organizing protein
De Kock, V. (Creator), Willaert, R. (Creator), Gansemans, Y. (Creator), Van Nieuwerburgh, F. (Creator), Baes, R. (Creator) & Peeters, E. (Creator), European Nucleotide Archive, 29 mei 2025
https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB83172
Dataset
Prediction of Conformational Variability for RRM proteins in inter3m data base
Gavalda Garcia, J. (Creator) & Vranken, W. (Supervisor), Zenodo, 14 feb. 2023
DOI: 10.5281/zenodo.7640833, https://doi.org/10.5281/zenodo.7640833
Dataset
Arabidopsis thaliana Phosphoenolpyruvate carboxylase PPC1 free form
Loris, R. (Creator), Prolic Kalinsek, M. (Creator) & Haesaerts, S. (Creator), Protein Data Bank, 12 apr. 2023
DOI: 10.2210/pdb8OJ9/pdb
Dataset
Chemical shift data for Vibrio cholerae HigA2
Loris, R. (Project Leader) & Hadzi, S. (Creator), BMRB - Biological magnetic resonance data bank, 20 jun. 2022
DOI: 10.13018/BMR51448
Dataset
ConforMine Molecular Dynamics Data: Conformational Variability, Secondary Structure Propensities and Molecular Dynamics Simulations
Gavalda Garcia, J. (Creator), Roca Martinez, J. (Creator) & Vranken, W. (Supervisor), Zenodo, 2023
DOI: 10.5281/zenodo.7575777, https://doi.org/10.5281/zenodo.7575777
Dataset

Structural Biology Brussels

Organisatieprofiel

Vingerafdruk

Samenwerkingen en hoofdonderzoeksgebieden uit de afgelopen vijf jaar

Duik in details

Ekaterina Baranova

Eva Beke

Safa Ben Taarit

Marjolijn Berghmans

Thijs Bodson

FWOTM1348: Een nieuw porine eiwit regelt de vorming van polysaccharide capsules, een belangrijke virulentiefactor in de prioritaire humane pathogeen Acinetobacter baumannii

FWOSB216: De novo ontwerp van een steroïdenbiosensor en karakterisering van zijn vermogen tot steroïdenfingerprinting

FWOTM1328: Zacht als zijde, sterk als staal: rationeel biotechniek van eiwit nanovezels voor de ontwikkeling van een nieuwe generatie textiel materialen

FWOSB198: Uibreiden van de Nanobody Toolbox: Computationele en Experimentele methodes voor het fuseren van Nanobodies met andere eiwitten

IOFPOC67: IOF PoC “Positieve Allosterische Modulatoren van Receptor Tyrosine Kinases met ligand-specificiteit en spatio-temporele precisie als een nieuwe therapeutische strategie.”

3D Nanoendoscopy-AFM: Redefining mechanosensitivity in bone cells.

A biosensor-based phage display selection method for automated, high-throughput Nanobody discovery

A color-tailored fluorogenic sensor for hydrogen peroxide

A comparative study between phenylglycine and phenylalanine derived peptide hydrogels: towards atomic elucidation

AFM and optical microscopy based nanomotion detection techniques and applications

UNIVERSITE CATHOLIQUE DE LOUVAIN (Externe Organisatie)

Research stay at the Centre de neurosciences psychiatriques (CNP)

Co-organizer 5th international TRP meeting in Leuven

Member of PhD committee of Silke Vercauteren “The genetic landscape underlying persistence in Escherichia coli” (Evenement)

ChemPhysBio2025 - Imaging Biology: Interdisciplinary Tools and Techniques to Unravel Cellular Dynamics

3D SUper-Resolutie tot cryo-ElectronenMIcroscopie voor de studie van nanoschaal subcellulaire dynamiek en structuur die verandert in Neurodegeneratieve ziekten - 3SURE MIND

Atomic force microscopy” (AFM)-nanobiotechnologie gebaseerd platform voor het bereiken van de dynamiek van afzonderlijke moleculen tot veelzijdige materialen en celmechanica

ELIXIR Infrastructuur voor Data en Services om Life-Sciences Onderzoek in Vlaanderen te versterken

INSTRUCT Flanders - Nanobodies4INSTRUCT

Voordelige 100 kV-cryogene elektronenmicroscoop met hoge resolutie voor de bepaling van bijna atomaire eiwitstructuur

The Lrs14-like AbfR1 homolog from Metallosphaera sedula is a nucleoid-organizing protein

Prediction of Conformational Variability for RRM proteins in inter3m data base

Arabidopsis thaliana Phosphoenolpyruvate carboxylase PPC1 free form

Chemical shift data for Vibrio cholerae HigA2

ConforMine Molecular Dynamics Data: Conformational Variability, Secondary Structure Propensities and Molecular Dynamics Simulations

Structural Biology Brussels

Organisatieprofiel

Vingerafdruk

Samenwerkingen en hoofdonderzoeksgebieden uit de afgelopen vijf jaar

Profielen

projecten

Onderzoeksoutput

Activiteiten

Uitrusting

Datasets