Dynamica van toxine-antitoxine stress respons netwerken: een interdisciplinaire computationele en in-vivo aanpak

De genomen van bactriën bevatten een aantal kleine operons die coderen voor een "toxine" en een corresponderend neutraliserend "antitoxine". Deze gen paren zijn gekend als toxin-antitoxin modules of TA modules. Over hun fysiologische rol wordt intensief gedebatteerd. Wij zullen TA modules gebruiken als modelsystemen voor gen regulatie en de integratie hiervan met andere types van regulatie in de cel op tranlationeel en post-translationeel niveau. Hiervoor zullen we een gecombineerde experimentele en computationele benadering gebruiken. De uitkomst van deze studies zal ons rechtstreeks inzicht geven in de waarschijnlijke fysiologische rol van verschillende families van TA modules en hoe de verschillende niveaus van regulatie (transcriptie, translatie en post-translationeel) interageren. deze informatie is ook cruciaal om te weten of TA modules geschikt zijn als mogelijke doelwitten voor het ontwikkelen van nieuwe types antibiotica.