Financiering FWO Hercules: ERA platform: Uitgebreid RNA Analyse platform - versie 2.0

De volgende stap in het domein van 'transcriptomics' is deze waarin de ruimtelijke informatie bewaard blijft, met andere woorden waar er in situ profilering van RNA expressie is met behoud van de histologie. In deze optiek
wensen we ons ERA platform (Extended RNA Analysis of Uitgebreid RNA analyse platform) naar het volgende niveau te brengen (versie 2.0). Dit zal ons specifiek toelaten om individuele expressie van genen of gensignaturen in het weefsel in kaart te brengen terwijl individuele cellen of celtypes worden gelokaliseerd en/of geïdentificeerd op basis van (antilichaam-gebaseerde) kleuring van bepaalde
merkers. In het bijzonder wensen wij een geavanceerde scanner aan te schaffen die hele weefselsecties kan inscannen (Axio Scan.Z1, Zeiss) en die toelaat nieuwe
technologieën zoals Spatial Transcriptomics of InSituPlex® (Ultivue Inc.) te incorporeren. Meteen willen we ook het bestaande EVOS imaging systeem en het HALO digitaal analyse platform uitbreiden en opwaarderen om te voldoen aan de stijgende vereisten van de partners in dit consortium om de allernieuwste vormen van biomerkeranalyse en zeer diepgaande profilering van weefsels te kunnen aanvatten.